六月十五日，他和湘军（谭延闿、赵恒惕）订立了停战协定。
八月七日发表了致李纯的电报，大肆攻击段内阁的亲日政策。
二十一日，又发表致冯国璋的通电，竟公然喊出“息战御侮”的口号来了。
吴佩孚态度的转变，应该与以下原因有关：
一、士兵久战疲惫，事实上，不能再向南深入；
二、湖南战争本是他的首功，督军却被张敬尧抢去，嘉奖虽然有他的份，但等级最低，这不能不使他这个自认出力最多的人心生怨恨。
三、国内反对内战、反对亲日的氛围日益浓厚，将士厌战情绪不断升高。
四、左路军在湘西几乎被湘粤联军全歼，这一战给吴的心里造成了极大的震撼。“车不落险地”，他很清楚，他的这支部队再往前打，势必孤军深入而越前途未卜。
五、最重要的是，吴在征湘之战中开始所以那么积极，是想为自己赚取政治资本，现在目的已达成。手里这支武装是吴安身立命之根本，他必须加以珍惜。
六、养敌自重，就算是能扫平西南，自己也就失去了价值。
徐树铮虽然很会耍手腕，也会笼络人，可是这次却是很失败。
他在衡阳和吴谈得非常投机，答应补助吴若干军费，以及发表吴的孚威将军名义，以交换吴佩孚的完全听命。
却不料衡阳密谈这一幕竟被曹锟知道了，大为光火，徐树铮竟收买他的部下，立刻提出严重的质问。
而吴佩孚则以为是徐树铮故意泄漏，以挑拨离间他和曹锟的关系，使他自己无法做人，从而对徐恨之入骨。
张怀芝和曹锟本来都是激烈的主战派，忽然发生了一百八十度的大转弯。曹锟一再请求回直隶养病，五月二十九日没有等待段祺瑞同意，就离开汉口，还把第一路司令部全部带走。
三十日张怀芝也率领亲信径返山东。这两位大将在离开汉口之前，曾与王占元、赵倜、陈光远、李纯交换意见，打算发出一个电报，假口“民生凋敝，不堪再战”，命令前方“停战待命”。
段祺瑞听说前线将帅公然主和，大为震动，赶紧活动疏通，花了很大气力才说服他们没有发出这个电报。
三个原来的主和派和三个原来的主战派，现在他们竟结成一体，最严重的是这个新的主和派领袖竟是曹锟。这对段的打击极大。他越来越感到他的武统大业，已经深陷危机。
祸不单行，直军前线全体将士也联名发表通电，力言湘省水患滔天，瘟疫流行，兵疲将惫，不堪再战。与此同时，前线直军的五位旅长也联名发表请假的电报。这五位旅长是王承斌、阎相文、萧耀南、张学颜、张福来。
我们已经知道，所谓请假就是怠工示威，五位旅长联名请假就是集体怠工。