最先向“山城”发动攻击的是随后赶来的017号潜艇。
017潜艇发射鱼雷的时机很巧妙，恰好和“凉风”处于一条线上，“山城”在017和“凉风”之间。
“山城”号战列舰的长度为215米，“凉风”号的长度只有111米，“山城”号庞大的身躯将“凉风”的视野全部隔断，导致“凉风”号对于鱼雷的袭击没有任何准备。
017潜艇一连发射了三枚鱼雷，当鱼雷拖着白色的水线划过海面的时候，马上被“山城”号观察员发现。
“山城”号全速前进，并且有一个明显的转向，顺利躲过鱼雷。
毫无准备的“凉风”倒了霉，一枚鱼雷险险擦着“山城”尾部穿过去，恰好命中“凉风”号。
鱼雷剧烈的爆炸直接将“凉风”号炸成两截，不到一分钟就沉没了，“山城”号失去了唯一的保护。
接下来三艘“幽灵”潜艇一共向“山城”号发射了16枚鱼雷，“山城”号被其中的9枚击中。
3点12分，一声惊天动地的爆炸之后，满载排水量33800吨的“山城”号沉没，成为关岛海战中沉没的第一艘战列舰。
“山城”是沉没的第一艘战列舰，却不是第一艘大型战舰，在“山城”沉没之前，“飞龙”号航空母舰已经被击沉，而且是被日军自己的驱逐舰击沉的。
遭到鱼雷机撞击之后，“飞龙”号无法起降战机，短时间内“飞龙”号已经失去作战能力。
“飞龙”号是中型舰队航母，苍龙级航母的改进型。
和“苍龙”级航母一样，“飞龙”号也存在武备过重，重心不稳，结构强度不足等严重问题。
在建设过程中，“飞龙”号的图纸几经修改，装甲防护有所增强，排水量增加了2000吨，舰岛也从右侧改到左侧，这并不是个好设计，南部非洲海军研究表明，飞行员在降落过程中一旦碰到麻烦，由于习惯性原因往往向左转，左舷岛式上层建筑造成的降落事故比右舷多一倍。
这个结论很正常，就如汽车驾驶员在正面相撞即将发生时，会下意识将方向盘向左打，避开驾驶位接受撞击一样，所以说副驾驶位置是最危险的。
日本的航空母舰，为了飞行甲板的性能，在钢制甲板上铺装了一层木地板，这样做好处很多，但也造成一旦着火很难控制火势，火势会迅速蔓延。
鱼雷机撞击在“飞龙”号甲板上的时候，“飞龙”号的甲板上还停放着20余架鱼雷机和轰炸机，这是为攻击联军舰队准备的，可是日军的侦察机不给力，到现在都没有找到联军舰队位置，“飞龙”号舰长又不敢把鱼雷机和轰炸机收回到机腹位置，那样的话，再用升降机把鱼雷机和轰炸机升上来，最起码要半个小时。
航空母舰作战别说半个小时，五分钟就已经很致命了，另一个时空日本人输掉中途岛战役之后，就将失利的主要原因归咎为“命运的五分钟”。
这其实就是日本人为了掩盖失利挽回颜面寻找的借口，根本就没有所谓的“命运五分钟”，再给日本人五年日本人都赢不了，美国就算输掉中途岛，最多半年太平洋舰队就能恢复实力，日本只要输一次，就会一直输下去。
甲板燃起大火之后，“飞龙”号的水手全力灭火，附近的一艘日军巡洋舰和一艘驱逐舰也过来帮忙。
为了不造成更大损失，“飞龙”号舰长命令将距离火场比较近的六艘鱼雷机全部推到海里去，这并没能拯救“飞龙”号的命运。
此时“飞龙”号浓烟滚滚，十余里外都能看得到。
更多轰炸机和鱼雷机蜂拥而至，一架“海鹞”扔下的500公斤炸弹将“飞龙”号甲板直接砸穿，在“飞龙”号内部爆炸，这次爆炸造成“飞龙”号超过一百人死亡，并且引燃了存放在油库里的优质航空燃油。
12点40分，“飞龙”号大火彻底失控，南云忠一命令弃舰，并且命令驱逐舰发射鱼雷将“飞龙”号击沉。