大理寺的职权虽然之前就定下来了，但司礼监方案却是从制度和律令方面予以明确承认，且据说后续还可能进一步将权威扩大到地方，所以大理寺官员只可能双手赞成，绝不会反对本部门的改制。
光禄寺整体被撤销，相应官员肯定不满，但又期盼着能被安排到好的去处，所以闹腾，也是三心两意的，不敢彻底恶了朱由崧。
至于通政司、中书科、行人司等机构，暂时并不用改制，一众官员自然也不会去闹。
翰林院、詹事府是升格了，即便有人对詹事府将选用有具体施政经验的官员出任有所不满，但这些话也是不好公开说的。
国子监，此次改制也没有涉及，因此国子监监生也不敢掺和到如此层面的国家大事中。
太医署的改制也是没人反对的，毕竟司礼监打出了惠及生民的口号，且医官不是官，只是有部分特权的医生，影响不到百官的地位，顶了天就是有进太医院的资格而已。
钦天监中要增设什么化学、地质、物理，怎么看都有些奇怪，但百官们现在根本顾不得钦天监的事情，至于钦天监内部的反对，对司礼监来说更是无足轻重，一个眼神就能压制的。
六科虽然地位被提到了类似隋唐的门下省，给事中的官品进一步提高了都给事中升为正四品、左右给事中升为正五品、给事中升为正六品但却失去了事后反对的权利，也失去了监督权，这其实一定限制了六科的权力，自是不能让六科上下满意的。
与之类似的是都察院，虽然御史们的官品大多都升了一级或级级左都御史正二品、右都御史从二品、左副都御史正三品、右副都御史从三品、左佥都御史正四品、右佥都御史从四品、监察御史正五品，巡按、巡漕、巡盐、巡江御史加右佥都御史衔虽然依旧保留了对人和事的监察权和弹劾权，但朝廷制定的政策不能反对，各地执行政策时也不能阻挠，就只能在政策推行后，根据结果进行抨击和弹劾，这也是限制了都察院的职权，让一众喷子们强烈不满······
“元翁啊！这两天反对司礼监草案的奏疏可是上了不少啊！”看着内阁里堆成山的奏折，王铎眉头紧锁的跟马士英说道。“可是这等奏疏上的越多，陛下就越是不满，只怕会很快追究司礼监草案是怎么泄漏的了！”
马士英摸了摸长须，点头道：“觉斯说的有道理，军机处还在审议司礼监草案，这些官是怎么知道的，陛下要是因此发难，可是一抓一个准呢！”
马士英也担心朱由崧会趁机清扫朝堂，所以他对王铎说道：“老夫和伯雅深陷其中，是不方便出面劝说这些官员的，还要请觉斯多加安抚，别惹得陛下不快了。”
王铎苦笑道：“我尽力而为吧，有些人劝不动啊！”
马士英意味深长的回应道：“劝不住也要劝，否则陛下为什么把这些奏疏发到内阁呢，不就是再看你我的态度吗？”