按下前线将帅不肯用命不说，当年五月初四，也就是朱由崧称帝后的第三天，经过反复的磋商后，东林党暂时占多数的南京官员们向朱由崧呈报了弘光朝第一份六部尚书、侍郎、都察院左右都御史的人选名单。
朱由崧审定名单后，正式任命马士英为兵部尚书、张慎言为吏部尚书、王铎为礼部尚书、高弘图为户部尚书、周堪赓任刑部尚书、王应熊为工部尚书、顾锡畴为左都御史、吴甡为右都御史、解学龙为刑部左侍郎、吕大器为兵部右侍郎、黄配玄为工部左侍郎、练国事为户部右侍郎、毕懋康为礼部左侍郎、姜曰广为工部右侍郎、李清为工科都给事中、章正宸为礼科都给事中、黄道周为光禄寺卿······
六部侍郎以下的确还没有填满，这主要是因为东林党主张对复起某些正人君子，拿这些职务虚席以待，对此，朱由崧也是认可了，那么接下来就是弘光朝的第一大事，组建内阁了。
五月初七，关于内阁人选，南京朝堂上发生了第一次激烈冲突。
当时，东林党推举高弘图、王铎、王应熊为内阁大学士，把马士英排除在外，马士英当然十分不满，立刻冲着自诩同为帝党的诚意伯刘孔昭使了眼色，刘孔昭便自己推荐自己进入内阁，群臣以“勋臣不入阁”的祖制加以反对，刘孔昭便转而推荐马士英入阁。
刘孔昭自我推荐的举动让部分朝臣产生了某种不安，所以便在两害取其轻者的想法下，把马士英纳入了廷推上报名单。
收到这番廷推名单后，朱由崧问王铎道：“先帝庙号、谥号定了吗？福忠王的庙号、谥号定了吗？先毗的尊号定了吗？”
王铎回报道：“礼部为先帝拟了怀宗、思宗、毅宗、威宗等四个庙号，钦天守道敏毅敦俭弘文襄武体仁致孝庄烈愍皇帝、绍天绎道刚明恪俭揆文奋武敦仁懋孝烈皇帝两个谥号；为福忠王拟了恭宗、共宗等两个庙号，贞纯肃哲圣敬仁毅恭皇帝、贞纯肃哲圣敬仁懿孝皇帝两个谥号，陵号熙陵；姚老娘娘尊号则也有两个，一为孝诚恭皇后、一为孝诚懿皇后；至于邹娘娘，臣等上尊号恪贞仁寿皇后。”
王铎顿了顿：“以上还请陛下审定。”
朱由崧把王铎报的尊号、庙号、谥号都写了下来，然后仔细的品砸了一番，这才说道：“先帝的庙号就定毅宗吧，谥号定绍天绎道刚明恪俭揆文奋武敦仁懋孝烈皇帝，毅宗烈皇帝······”