从广州派遣来的建筑工程队按照实习小组事先勘察的地形地貌，在工地打下许多小木桩子，随后，由招募来得南沙村民组成土建队开始挖掘渠道，首先挖好的是尾水渠，用来排泄掉在土方工程中产生的渗流。
尾水渠完成之后，土建队在邹枫的指导下挖掘水轮坑，这个水轮坑的底部铺设了木板，用来减少摩擦力，加速水的分流，也可以避免水流冲刷掉两边侧壁的泥土。随后他开始指导建造曲线部分，这部分用木制的肋材和板材建造，固定在在水轮坑里，曲线部内部产生的空隙用石块填充，最后用木板封闭。
工厂湾这里有一个天然的水势落差，所以邹枫就省却了原本水渠工程中最大的一个部分，建造滚水坝来抬高上游水位。经过计算，这个河湾转弯处的自然地形落差足以产生足够推动水轮的动能。如果要建造滚水坝的话，就会牵扯到修建围堰等一系列工程。
导水渠的工程进展很快，水渠底部用石块水泥砌衬，与河道相邻的地方暂时没有挖开，而是修建了一个简单的闸门，用来控制水流进出。工程忙碌到快入夏的时候，从临高来了一批技工和设备――他们是来组装水轮机的。
水轮机对元老们来说其实一项十分陌生的技术。因为中国从未引入过近代水轮机。幸好它的结构和原理都非常简单，对材料的要求也不高，复原起来相对容易，安装的时候也无需元老到场指挥。
水轮和水轮坑“曲线部”的空隙越小越好，但是又不能小到会彼此磨擦到，所以在安装前，所有的配件都留有一定的余量。在现场，所有配件的尺寸和形状都要经过技工仔细测量之后才开始切割安装。
工人们首先安装的是水轮机的主轴，这是一根用复合桅杆技术，用多根木料拼接铁箍箍成的沉重木轴。木轴的两端是用铁箍固定住的铁质的轴颈，被插入水轮坑两侧的铸铁轴承里。铸铁轴承只是一个外壳，内部原本是青铜的滑动轴承。而这里采用的是大型滚珠轴承。改用滚珠轴承的好处不言而喻，减小了摩擦力，水轮机的运转效率大幅度提高。
仔细的校对过水平之后工人们安装上了主轴，随后他们将辐条安装在木轴上预开的狭槽内。水轮的轮圈由一片一片的厚木板拼成，轮圈安装在辐条的顶端。最后技工在轮圈的厚木板上凿出细槽，插入木制的叶片。每个叶片被插入前现在上面钻两个小孔，小孔内侧用一端固定的皮革覆盖，这其实就是一个简单的单向阀门。当水流入水斗的时候，阀门自动关闭，水流出的时候阀门开启，以避免水斗从水轮坑升起形成的内部真空。真空会妨碍出水，影响运转效率。